Le 
conseil d’administration de FNE Pays de la Loire se compose en 2017 de 11 administrateurs élus en assemblée générale. Ils représentent les fédérations départementales et les associations régionales adhérentes à FNE Pays de la Loire. Le Bureau de FNE Pays de la Loire est composé des administrateurs suivants:
Président : Jean-Christophe GAVALLET
Vice-président : Yves LEPAGE
Secrétaire : Yves LE QUELLEC
Trésorière : Sophie JONVILLE
Benoit DUCHENNE
L’équipe salariée se compose d’un coordinateur : Xavier METAY et d’un chargé de mission « suivi législatif et expertise réglementaire » : Benjamin HOGOMMAT.
Depuis le 16 octobre 2017 et jusqu’à la mi-juin 2018, Claire HAMARD est volontaire en Service Civique au sein de FNE Pays de la Loire.
Depuis le 12 mars 2018 et jusqu’au 14 septembre 2018, Noémie MOREL est stagiaire en Master 2 Droit de l’environnement et de l’urbanisme à Lyon.