Le 
conseil d’administration de FNE Pays de la Loire se compose en 2020 de 12 administrateurs élus en assemblée générale. Ils représentent les fédérations départementales et les associations régionales adhérentes à FNE Pays de la Loire. Le Bureau de FNE Pays de la Loire est composé des administrateurs suivants:
Président : Jean-Christophe GAVALLET
Vice-président : Yves LEPAGE
Secrétaire : Yves LE QUELLEC
Trésorière : Sophie JONVILLE
Benoit DUCHENNE
L’équipe salariée se compose de 3 salariés :
– Xavier METAY, coordinateur
– Benjamin HOGOMMAT, chargé de mission Juridique
– Noémie MOREL, chargée de mission Eau et Littoral
Depuis la mi-septembre 2019 et pour 8 mois, Agathe COURANT est volontaire en Service Civique au sein de FNE Pays de la Loire.