Le 
conseil d’administration de FNE Pays de la Loire se compose en 2017 de 11 administrateurs élus en assemblée générale. Ils représentent les fédérations départementales et les associations régionales adhérentes à FNE Pays de la Loire. Le Bureau de FNE Pays de la Loire est composé des administrateurs suivants:
Président : Jean-Christophe GAVALLET
Vice-président : Yves LEPAGE
Secrétaire : Yves LE QUELLEC
Trésorière : Sophie JONVILLE
Benoit DUCHENNE
L’équipe salariée se compose d’un coordinateur : Xavier METAY et d’un chargé de mission juridique : Benjamin HOGOMMAT.
Depuis le 18 juin 2018 et jusqu’à la mi-février 2019, Jérôme VIGNERON est volontaire en Service Civique au sein de FNE Pays de la Loire.