Le 
conseil d’administration de FNE Pays de la Loire se compose en 2017 de 11 administrateurs élus en assemblée générale. Ils représentent les fédérations départementales et les associations régionales adhérentes à FNE Pays de la Loire. Le Bureau de FNE Pays de la Loire est composé des administrateurs suivants:
Président : Jean-Christophe GAVALLET
Vice-président : Yves LEPAGE
Secrétaire : Yves LE QUELLEC
Trésorière : Sophie JONVILLE
Benoit DUCHENNE
L’équipe salariée se compose d’un coordinateur : Xavier METAY et d’un chargé de mission « suivi législatif et expertise réglementaire » : Benjamin HOGOMMAT.
Depuis le 13 mars et jusqu’au 15 septembre 2017, Mathilde GOUEFFON, étudiante en Master 2 « Droit international de l’environnement » est en stage à FNE Pays de la Loire.